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新聞資訊

在分子生物學(xué)的世界里,有一項(xiàng)看似微小卻至關(guān)重要的技術(shù)——當(dāng)科學(xué)家將DNA樣本注入瓊脂糖凝膠的孔槽,接通電源,原本無色的核酸便在電場作用下開始“賽跑”。而讓這場微觀競賽變得肉眼可見的“魔法藥劑”,正是我們今天要講述的主角:核酸電泳染料。

從實(shí)驗(yàn)室到診斷室,從犯罪現(xiàn)場到疫情追蹤,這些神奇的染色劑讓不可見的生命密碼顯露出真容。它們的進(jìn)化史,是一部關(guān)于安全、精準(zhǔn)與創(chuàng)新的科學(xué)史詩。

第一章:溴化乙錠時代-功勛染料的雙面性

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EB粉末

20世紀(jì)中葉,分子生物學(xué)迎來爆發(fā)式發(fā)展。在科學(xué)家迫切需要在凝膠中可視化DNA的背景下,溴化乙錠(Ethidium bromide, EB)登上了歷史舞臺。這種橙紅色粉末溶于水后,能插入DNA雙螺旋的堿基對之間,在紫外燈照射下發(fā)出明亮的橙紅色熒光,即使少至10-20納克的DNA也無處遁形。

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EB的化學(xué)結(jié)構(gòu)及結(jié)合DNA機(jī)制圖示

EB因其高靈敏度、低成本和操作簡便迅速風(fēng)靡全球?qū)嶒?yàn)室。它幾乎成為核酸電泳的代名詞,支撐了包括人類基因組計劃在內(nèi)的無數(shù)重大研究。然而隨著時間推移,這種功勛染料逐漸暴露出令人不安的另一面:

科學(xué)研究證實(shí)EB具有強(qiáng)誘變性和潛在致癌風(fēng)險。它能穿透皮膚和細(xì)胞膜,干擾DNA復(fù)制——這一特性使其成為完美的染色劑,卻也成了實(shí)驗(yàn)人員的健康噩夢。實(shí)驗(yàn)后的凝膠處理更是棘手難題,需經(jīng)過復(fù)雜的凈化流程才能避免環(huán)境污染。

第二章:安全變革-綠色染料的崛起

21世紀(jì)初,環(huán)保與實(shí)驗(yàn)室安全理念興起,推動核酸染料進(jìn)入“綠色革命”??茖W(xué)家們開始尋找既能保持EB的高靈敏度,又能大幅降低毒性的替代品。

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SYBR Green I 染色凝膠電泳圖

SYBR Green系列率先突圍。這種染料源于海洋珊瑚蟲熒光蛋白的研究靈感,與DNA結(jié)合后信號強(qiáng)度可達(dá)EB的5-10倍,且誘變性顯著降低。但缺點(diǎn)也顯而易見——光穩(wěn)定性差,需避光操作;改變 DNA 電泳遷移率,使得 DNA 條帶出現(xiàn)彌散或位移現(xiàn)象,降低了電泳結(jié)果的準(zhǔn)確性。目前SYBR Green染料更多應(yīng)用于熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)中,核酸電泳實(shí)驗(yàn)中較少使用。

隨后更多創(chuàng)新產(chǎn)品涌現(xiàn):

GoldView:中國自主研發(fā)的低毒染料。

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GoldView與EB靈敏度對比

GoldView是一種改進(jìn)版的核酸電泳染料,通常被認(rèn)為是EB的替代品。GoldView在紫外光照射下同樣可以與DNA結(jié)合并顯示出熒光,具有較高的靈敏度,能夠檢測到微量DNA。此外,它的穩(wěn)定性也非常好,適用于各種實(shí)驗(yàn)條件,同時價格低廉,因此在很多實(shí)驗(yàn)室中,GoldView逐漸替代了EB成為主流的核酸染料。

GoldView的安全性問題一直存在爭議,同時存在背景信號高等問題。

GelRed/GelGreen:大分子安全染料。

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GelRedGelGreen染色的DNA電泳圖

GelRed/GelGreen分子結(jié)構(gòu)較大,難以穿透細(xì)胞膜,被列為“非誘變性染料”,具有低毒性/無毒性的優(yōu)點(diǎn),更加安全、環(huán)保,特別適用于需要高度環(huán)保的實(shí)驗(yàn)室環(huán)境。在紫外光下與DNA結(jié)合時,染料分子會產(chǎn)生強(qiáng)烈的熒光,比EB靈敏度更高,方便實(shí)驗(yàn)者進(jìn)行電泳分析,也是目前廣泛使用的一類核酸染料。

GelRed 和 GelGreen 不容易穿透細(xì)胞

GelRed/GelGreen優(yōu)勢明顯,但價格較高;此外由于分子量大,對DNA遷移的影響更大,容易出現(xiàn)DNA條帶變形、難以分離等問題。

第三章:創(chuàng)新突破-從紫外到藍(lán)光

以往的核酸染料通常需要紫外光源來激發(fā)染料與DNA結(jié)合后的熒光,紫外光是一種高能輻射,會對實(shí)驗(yàn)人員的皮膚和眼睛造成傷害,長期接觸可能導(dǎo)致皮膚癌等健康問題。

藍(lán)光激發(fā)核酸染料的出現(xiàn)為解決紫外光染料的安全性問題提供了新的解決方案。與紫外光源相比,藍(lán)光的波長較長,對實(shí)驗(yàn)者的傷害小,因此成為了現(xiàn)代實(shí)驗(yàn)室中一種更為安全的激發(fā)光源。

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藍(lán)光下的DNA條帶

藍(lán)光激發(fā)染料通常在450-490nm的波長范圍內(nèi)激發(fā)熒光,這使得它們在使用時既能避免紫外光的危害,又能提供足夠的靈敏度來檢測DNA、RNA等核酸樣本。隨著對安全性的重視,越來越多的實(shí)驗(yàn)室開始采用藍(lán)光激發(fā)電泳染料。

東盛AIE-Gelgreen即是一種適合藍(lán)光激發(fā)的核酸染料,而且具有AIE(Aggregation-Induced Emission,聚焦誘導(dǎo)發(fā)光)特性,只在有鏈結(jié)構(gòu)的位置才會結(jié)合而形成聚集體或被限制運(yùn)動,從而體現(xiàn)出更大的“從無到有”熒光開關(guān)比,實(shí)現(xiàn)5分鐘快速結(jié)合及痕量物質(zhì)檢測,是一種創(chuàng)新性極高的高靈敏度核酸染料。

東盛DSView與AIE-Gelgreen核酸染料信息

AIE-Gelgreen具有非常高的信噪比,背景干凈,DNA條帶清晰。且分子量適中,對DNA遷移的影響較小,適合預(yù)染凝膠使用。兼容藍(lán)光和紫外光激發(fā),適用于瓊脂糖凝膠電泳和聚丙烯酰胺凝膠電泳中的dsDNA,ssDNA和RNA染色,是一種理想的核酸染料。

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回顧核酸染料的發(fā)展史,從高危的EB到更加安全、靈敏的藍(lán)光染料AIE-Gelgreen,不僅是一部技術(shù)創(chuàng)新史,更體現(xiàn)了科學(xué)理念的進(jìn)化:從追求結(jié)果到敬畏生命,從征服自然到和諧共生。

那些在紫外燈下或藍(lán)光儀中閃爍的熒光條帶,不僅是DNA的蹤跡,更是人類科學(xué)理性與人文關(guān)懷交相輝映的光芒。每一次凝膠中亮起的藍(lán)色熒光,都在默默講述著那些讓科學(xué)更安全、更精準(zhǔn)的智慧故事。